真菌发酵食品包括：

1. 红曲米：由红曲菌发酵而成，可以用来制作红曲米酒和红曲豆腐等食品。

2. 麹菌发酵食品：如酱油、米酵等，由麹菌和其他微生物共同发酵而成。

3. 酵母菌发酵食品：如酵母发酵的面包、啤酒、蛋糕等。

4. 蘑菇类食品：包括木耳、香菇、金针菇等，由真菌发酵而成的食品。

5. 奶酪：部分奶酪是通过真菌发酵而成的，例如蓝纹奶酪和卡门贝尔奶酪等。

6. 燕麦发酵食品：燕麦微生态食品，是燕麦麸的发酵产品，由微生物发酵而成，其中常见的菌类是乳酸菌和酵母菌。

7. 真菌酵素：某些真菌可以分泌酶，如木质素酶、纤维素酶等，在食品加工过程中具有重要作用。